Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLF1Q13351 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms