Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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