Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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NR1H3Q13133 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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NR1H3Q13133 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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NR1H3Q13133 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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NR1H3Q13133 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
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NR1H3Q13133 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NR1H3Q13133 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
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