Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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TRAF1Q13077 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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TRAF1Q13077 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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TRAF1Q13077 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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TRAF1Q13077 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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TRAF1Q13077 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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TRAF1Q13077 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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TRAF1Q13077 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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