Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSTF3Q12996 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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