Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTP4A2Q12974 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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