Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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FOXO1Q12778 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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FOXO1Q12778 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
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