Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CGNL1Q0VF96 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms