Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EP300Q09472 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EP300Q09472 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
EP300Q09472 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EP300Q09472 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EP300Q09472 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EP300Q09472 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EP300Q09472 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EP300Q09472 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
EP300Q09472 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
EP300Q09472 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EP300Q09472 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EP300Q09472 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EP300Q09472 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EP300Q09472 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EP300Q09472 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EP300Q09472 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EP300Q09472 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EP300Q09472 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EP300Q09472 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EP300Q09472 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EP300Q09472 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EP300Q09472 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EP300Q09472 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EP300Q09472 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EP300Q09472 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EP300Q09472 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EP300Q09472 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EP300Q09472 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EP300Q09472 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EP300Q09472 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EP300Q09472 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EP300Q09472 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EP300Q09472 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EP300Q09472 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EP300Q09472 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EP300Q09472 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EP300Q09472 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EP300Q09472 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EP300Q09472 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EP300Q09472 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EP300Q09472 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EP300Q09472 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EP300Q09472 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EP300Q09472 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EP300Q09472 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EP300Q09472 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EP300Q09472 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EP300Q09472 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EP300Q09472 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EP300Q09472 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EP300Q09472 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EP300Q09472 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EP300Q09472 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EP300Q09472 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EP300Q09472 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EP300Q09472 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EP300Q09472 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EP300Q09472 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EP300Q09472 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EP300Q09472 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
EP300Q09472 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
EP300Q09472 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EP300Q09472 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
EP300Q09472 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EP300Q09472 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EP300Q09472 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EP300Q09472 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EP300Q09472 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EP300Q09472 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EP300Q09472 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EP300Q09472 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EP300Q09472 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EP300Q09472 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EP300Q09472 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EP300Q09472 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
EP300Q09472 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EP300Q09472 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EP300Q09472 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EP300Q09472 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EP300Q09472 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
EP300Q09472 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
EP300Q09472 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
EP300Q09472 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EP300Q09472 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EP300Q09472 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EP300Q09472 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EP300Q09472 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EP300Q09472 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EP300Q09472 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EP300Q09472 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EP300Q09472 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EP300Q09472 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EP300Q09472 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EP300Q09472 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
EP300Q09472 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EP300Q09472 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EP300Q09472 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EP300Q09472 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EP300Q09472 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms