Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNA1Q09470 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms