Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP4Q09028 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms