Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms