Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABPB1Q06547 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms