Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms