Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE3AQ05086 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms