Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms