Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms