Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
XPCQ01831 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
XPCQ01831 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
XPCQ01831 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
XPCQ01831 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
XPCQ01831 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
XPCQ01831 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
XPCQ01831 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XPCQ01831 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XPCQ01831 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XPCQ01831 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
XPCQ01831 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
XPCQ01831 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XPCQ01831 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
XPCQ01831 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
XPCQ01831 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XPCQ01831 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XPCQ01831 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XPCQ01831 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XPCQ01831 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
XPCQ01831 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XPCQ01831 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
XPCQ01831 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
XPCQ01831 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
XPCQ01831 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XPCQ01831 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
XPCQ01831 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
XPCQ01831 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
XPCQ01831 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
XPCQ01831 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XPCQ01831 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XPCQ01831 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XPCQ01831 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XPCQ01831 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XPCQ01831 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
XPCQ01831 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
XPCQ01831 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
XPCQ01831 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
XPCQ01831 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
XPCQ01831 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
XPCQ01831 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
XPCQ01831 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
XPCQ01831 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
XPCQ01831 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
XPCQ01831 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
XPCQ01831 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
XPCQ01831 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
XPCQ01831 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
XPCQ01831 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
XPCQ01831 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
XPCQ01831 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
XPCQ01831 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
XPCQ01831 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
XPCQ01831 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
XPCQ01831 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
XPCQ01831 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
XPCQ01831 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
XPCQ01831 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
XPCQ01831 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
XPCQ01831 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
XPCQ01831 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
XPCQ01831 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
XPCQ01831 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
XPCQ01831 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
XPCQ01831 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
XPCQ01831 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
XPCQ01831 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
XPCQ01831 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
XPCQ01831 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
XPCQ01831 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
XPCQ01831 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
XPCQ01831 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
XPCQ01831 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
XPCQ01831 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
XPCQ01831 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
XPCQ01831 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
XPCQ01831 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
XPCQ01831 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
XPCQ01831 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
XPCQ01831 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
XPCQ01831 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
XPCQ01831 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
XPCQ01831 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
XPCQ01831 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
XPCQ01831 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
XPCQ01831 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
XPCQ01831 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
XPCQ01831 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
XPCQ01831 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
XPCQ01831 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
XPCQ01831 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
XPCQ01831 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
XPCQ01831 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
XPCQ01831 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
XPCQ01831 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
XPCQ01831 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
XPCQ01831 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
XPCQ01831 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
XPCQ01831 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
XPCQ01831 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms