Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFITM3Q01628 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms