Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms