Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF9Q00978 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms