Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP2C1P98194 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP2C1P98194 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP2C1P98194 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP2C1P98194 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP2C1P98194 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP2C1P98194 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP2C1P98194 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP2C1P98194 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP2C1P98194 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATP2C1P98194 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATP2C1P98194 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATP2C1P98194 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATP2C1P98194 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2C1P98194 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms