Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms