Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMF1P82094 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMF1P82094 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMF1P82094 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMF1P82094 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMF1P82094 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMF1P82094 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMF1P82094 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMF1P82094 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMF1P82094 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMF1P82094 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMF1P82094 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMF1P82094 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMF1P82094 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMF1P82094 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMF1P82094 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMF1P82094 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMF1P82094 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMF1P82094 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMF1P82094 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMF1P82094 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMF1P82094 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMF1P82094 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMF1P82094 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMF1P82094 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMF1P82094 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMF1P82094 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMF1P82094 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMF1P82094 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TMF1P82094 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMF1P82094 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMF1P82094 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMF1P82094 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMF1P82094 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMF1P82094 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMF1P82094 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMF1P82094 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMF1P82094 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMF1P82094 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TMF1P82094 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMF1P82094 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMF1P82094 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMF1P82094 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMF1P82094 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMF1P82094 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMF1P82094 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TMF1P82094 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMF1P82094 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMF1P82094 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMF1P82094 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TMF1P82094 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
TMF1P82094 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMF1P82094 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TMF1P82094 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMF1P82094 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMF1P82094 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMF1P82094 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMF1P82094 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMF1P82094 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TMF1P82094 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TMF1P82094 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TMF1P82094 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMF1P82094 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMF1P82094 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TMF1P82094 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMF1P82094 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMF1P82094 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMF1P82094 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMF1P82094 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMF1P82094 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMF1P82094 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMF1P82094 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMF1P82094 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMF1P82094 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMF1P82094 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMF1P82094 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMF1P82094 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMF1P82094 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMF1P82094 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMF1P82094 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMF1P82094 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMF1P82094 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMF1P82094 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMF1P82094 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TMF1P82094 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMF1P82094 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMF1P82094 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMF1P82094 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMF1P82094 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMF1P82094 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMF1P82094 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMF1P82094 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMF1P82094 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMF1P82094 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMF1P82094 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMF1P82094 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMF1P82094 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TMF1P82094 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMF1P82094 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TMF1P82094 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms