Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP1P78357 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms