Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P63132 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms