Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-21P61565 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms