Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHMP4BP1P59074 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHMP4BP1P59074 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHMP4BP1P59074 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHMP4BP1P59074 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHMP4BP1P59074 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHMP4BP1P59074 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHMP4BP1P59074 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHMP4BP1P59074 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP4BP1P59074 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP4BP1P59074 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP4BP1P59074 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP4BP1P59074 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP4BP1P59074 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP4BP1P59074 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP4BP1P59074 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP4BP1P59074 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP4BP1P59074 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP4BP1P59074 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP4BP1P59074 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP4BP1P59074 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP4BP1P59074 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP4BP1P59074 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP4BP1P59074 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP4BP1P59074 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP4BP1P59074 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP4BP1P59074 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP4BP1P59074 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP4BP1P59074 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP4BP1P59074 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP4BP1P59074 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP4BP1P59074 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP4BP1P59074 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP4BP1P59074 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP4BP1P59074 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP4BP1P59074 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP4BP1P59074 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP4BP1P59074 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP4BP1P59074 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP4BP1P59074 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP4BP1P59074 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP4BP1P59074 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP4BP1P59074 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms