Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms