Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LOXL3P58215 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms