Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP107P57740 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP107P57740 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP107P57740 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP107P57740 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP107P57740 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP107P57740 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP107P57740 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP107P57740 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP107P57740 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP107P57740 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP107P57740 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP107P57740 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP107P57740 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP107P57740 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP107P57740 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP107P57740 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP107P57740 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP107P57740 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP107P57740 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP107P57740 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP107P57740 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP107P57740 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP107P57740 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP107P57740 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP107P57740 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP107P57740 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP107P57740 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP107P57740 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP107P57740 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP107P57740 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP107P57740 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP107P57740 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP107P57740 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP107P57740 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP107P57740 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP107P57740 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP107P57740 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP107P57740 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP107P57740 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP107P57740 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP107P57740 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP107P57740 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP107P57740 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP107P57740 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP107P57740 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP107P57740 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP107P57740 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP107P57740 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP107P57740 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP107P57740 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP107P57740 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP107P57740 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP107P57740 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP107P57740 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP107P57740 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP107P57740 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP107P57740 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP107P57740 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP107P57740 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP107P57740 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP107P57740 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP107P57740 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP107P57740 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP107P57740 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP107P57740 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP107P57740 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP107P57740 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP107P57740 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP107P57740 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP107P57740 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP107P57740 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP107P57740 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP107P57740 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP107P57740 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP107P57740 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP107P57740 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP107P57740 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP107P57740 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP107P57740 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP107P57740 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP107P57740 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP107P57740 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP107P57740 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP107P57740 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP107P57740 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP107P57740 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP107P57740 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP107P57740 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP107P57740 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP107P57740 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP107P57740 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP107P57740 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP107P57740 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP107P57740 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP107P57740 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP107P57740 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP107P57740 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP107P57740 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP107P57740 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms