Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBASH3AP57075 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms