Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms