Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP98P52948 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP98P52948 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP98P52948 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP98P52948 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP98P52948 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP98P52948 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP98P52948 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP98P52948 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP98P52948 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUP98P52948 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUP98P52948 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUP98P52948 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUP98P52948 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUP98P52948 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUP98P52948 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUP98P52948 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUP98P52948 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUP98P52948 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP98P52948 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP98P52948 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP98P52948 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP98P52948 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP98P52948 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP98P52948 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP98P52948 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP98P52948 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP98P52948 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP98P52948 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP98P52948 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP98P52948 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP98P52948 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP98P52948 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP98P52948 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP98P52948 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP98P52948 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP98P52948 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP98P52948 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP98P52948 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP98P52948 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP98P52948 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP98P52948 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP98P52948 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP98P52948 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP98P52948 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP98P52948 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP98P52948 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP98P52948 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP98P52948 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP98P52948 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP98P52948 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP98P52948 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP98P52948 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP98P52948 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP98P52948 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP98P52948 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP98P52948 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP98P52948 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP98P52948 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP98P52948 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP98P52948 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP98P52948 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP98P52948 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP98P52948 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP98P52948 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP98P52948 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP98P52948 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP98P52948 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP98P52948 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP98P52948 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP98P52948 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP98P52948 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP98P52948 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP98P52948 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP98P52948 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP98P52948 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP98P52948 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP98P52948 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP98P52948 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP98P52948 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP98P52948 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP98P52948 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP98P52948 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP98P52948 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP98P52948 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP98P52948 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP98P52948 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP98P52948 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP98P52948 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP98P52948 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP98P52948 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP98P52948 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP98P52948 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP98P52948 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP98P52948 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP98P52948 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP98P52948 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP98P52948 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP98P52948 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP98P52948 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms