Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms