Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK4P51957 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK4P51957 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK4P51957 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK4P51957 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK4P51957 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK4P51957 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK4P51957 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK4P51957 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK4P51957 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK4P51957 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK4P51957 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK4P51957 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK4P51957 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK4P51957 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK4P51957 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK4P51957 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK4P51957 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK4P51957 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK4P51957 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK4P51957 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK4P51957 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK4P51957 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK4P51957 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK4P51957 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK4P51957 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK4P51957 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK4P51957 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK4P51957 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK4P51957 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK4P51957 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK4P51957 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK4P51957 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK4P51957 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK4P51957 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK4P51957 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK4P51957 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK4P51957 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK4P51957 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK4P51957 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK4P51957 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK4P51957 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK4P51957 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK4P51957 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK4P51957 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK4P51957 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK4P51957 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK4P51957 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK4P51957 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK4P51957 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK4P51957 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK4P51957 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK4P51957 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK4P51957 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK4P51957 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK4P51957 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK4P51957 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK4P51957 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK4P51957 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK4P51957 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK4P51957 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK4P51957 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK4P51957 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK4P51957 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK4P51957 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK4P51957 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEK4P51957 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEK4P51957 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEK4P51957 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEK4P51957 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEK4P51957 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEK4P51957 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NEK4P51957 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEK4P51957 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NEK4P51957 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEK4P51957 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEK4P51957 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEK4P51957 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEK4P51957 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK4P51957 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK4P51957 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK4P51957 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK4P51957 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK4P51957 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK4P51957 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK4P51957 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK4P51957 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK4P51957 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK4P51957 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK4P51957 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK4P51957 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK4P51957 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK4P51957 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK4P51957 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK4P51957 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK4P51957 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK4P51957 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK4P51957 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK4P51957 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK4P51957 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms