Protein–RNA interactions for Protein: P50120

RBP2, Retinol-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP2P50120 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBP2P50120 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBP2P50120 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RBP2P50120 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBP2P50120 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBP2P50120 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBP2P50120 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBP2P50120 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBP2P50120 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBP2P50120 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBP2P50120 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBP2P50120 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBP2P50120 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBP2P50120 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RBP2P50120 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBP2P50120 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBP2P50120 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBP2P50120 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBP2P50120 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBP2P50120 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBP2P50120 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBP2P50120 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBP2P50120 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBP2P50120 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBP2P50120 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBP2P50120 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBP2P50120 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBP2P50120 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBP2P50120 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBP2P50120 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBP2P50120 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBP2P50120 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBP2P50120 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBP2P50120 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBP2P50120 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBP2P50120 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBP2P50120 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBP2P50120 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBP2P50120 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBP2P50120 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBP2P50120 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBP2P50120 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBP2P50120 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBP2P50120 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBP2P50120 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBP2P50120 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBP2P50120 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBP2P50120 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBP2P50120 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBP2P50120 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBP2P50120 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBP2P50120 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBP2P50120 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBP2P50120 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBP2P50120 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBP2P50120 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBP2P50120 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBP2P50120 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBP2P50120 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBP2P50120 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBP2P50120 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBP2P50120 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBP2P50120 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBP2P50120 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBP2P50120 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBP2P50120 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBP2P50120 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBP2P50120 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBP2P50120 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBP2P50120 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBP2P50120 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBP2P50120 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBP2P50120 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBP2P50120 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBP2P50120 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBP2P50120 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBP2P50120 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBP2P50120 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBP2P50120 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBP2P50120 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBP2P50120 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBP2P50120 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RBP2P50120 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBP2P50120 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBP2P50120 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBP2P50120 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RBP2P50120 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBP2P50120 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBP2P50120 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBP2P50120 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBP2P50120 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBP2P50120 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBP2P50120 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBP2P50120 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBP2P50120 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBP2P50120 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBP2P50120 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBP2P50120 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBP2P50120 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBP2P50120 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms