Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFBP49765 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms