Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTPAP49638 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTPAP49638 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTPAP49638 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTPAP49638 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TTPAP49638 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TTPAP49638 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTPAP49638 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTPAP49638 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TTPAP49638 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTPAP49638 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTPAP49638 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTPAP49638 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTPAP49638 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TTPAP49638 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TTPAP49638 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTPAP49638 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTPAP49638 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTPAP49638 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TTPAP49638 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
TTPAP49638 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TTPAP49638 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TTPAP49638 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TTPAP49638 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TTPAP49638 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TTPAP49638 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
TTPAP49638 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TTPAP49638 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TTPAP49638 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTPAP49638 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTPAP49638 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTPAP49638 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTPAP49638 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTPAP49638 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTPAP49638 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTPAP49638 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTPAP49638 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTPAP49638 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTPAP49638 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTPAP49638 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTPAP49638 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TTPAP49638 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TTPAP49638 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTPAP49638 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTPAP49638 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTPAP49638 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTPAP49638 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTPAP49638 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTPAP49638 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TTPAP49638 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTPAP49638 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTPAP49638 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTPAP49638 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTPAP49638 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTPAP49638 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTPAP49638 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTPAP49638 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTPAP49638 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTPAP49638 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTPAP49638 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTPAP49638 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTPAP49638 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TTPAP49638 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TTPAP49638 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TTPAP49638 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TTPAP49638 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TTPAP49638 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TTPAP49638 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TTPAP49638 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TTPAP49638 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TTPAP49638 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TTPAP49638 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TTPAP49638 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TTPAP49638 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TTPAP49638 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TTPAP49638 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TTPAP49638 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TTPAP49638 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TTPAP49638 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TTPAP49638 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TTPAP49638 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TTPAP49638 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TTPAP49638 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TTPAP49638 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TTPAP49638 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TTPAP49638 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TTPAP49638 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TTPAP49638 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TTPAP49638 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TTPAP49638 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TTPAP49638 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TTPAP49638 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TTPAP49638 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
TTPAP49638 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TTPAP49638 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TTPAP49638 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
TTPAP49638 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTPAP49638 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TTPAP49638 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTPAP49638 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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