Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms