Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPD2P43304 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPD2P43304 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPD2P43304 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPD2P43304 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPD2P43304 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPD2P43304 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPD2P43304 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPD2P43304 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GPD2P43304 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPD2P43304 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPD2P43304 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPD2P43304 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GPD2P43304 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPD2P43304 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPD2P43304 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPD2P43304 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPD2P43304 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPD2P43304 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPD2P43304 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPD2P43304 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPD2P43304 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPD2P43304 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPD2P43304 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPD2P43304 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPD2P43304 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPD2P43304 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPD2P43304 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPD2P43304 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPD2P43304 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPD2P43304 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPD2P43304 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPD2P43304 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPD2P43304 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPD2P43304 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPD2P43304 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPD2P43304 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GPD2P43304 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GPD2P43304 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPD2P43304 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPD2P43304 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPD2P43304 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPD2P43304 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPD2P43304 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPD2P43304 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPD2P43304 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPD2P43304 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPD2P43304 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPD2P43304 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPD2P43304 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPD2P43304 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPD2P43304 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPD2P43304 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPD2P43304 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPD2P43304 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPD2P43304 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPD2P43304 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPD2P43304 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPD2P43304 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPD2P43304 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPD2P43304 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPD2P43304 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPD2P43304 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPD2P43304 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPD2P43304 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPD2P43304 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPD2P43304 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPD2P43304 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPD2P43304 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPD2P43304 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPD2P43304 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GPD2P43304 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPD2P43304 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPD2P43304 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPD2P43304 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPD2P43304 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPD2P43304 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPD2P43304 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPD2P43304 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPD2P43304 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPD2P43304 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPD2P43304 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPD2P43304 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPD2P43304 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPD2P43304 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPD2P43304 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPD2P43304 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPD2P43304 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GPD2P43304 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPD2P43304 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GPD2P43304 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPD2P43304 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPD2P43304 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPD2P43304 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPD2P43304 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPD2P43304 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPD2P43304 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPD2P43304 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPD2P43304 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPD2P43304 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms