Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP62P37198 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP62P37198 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP62P37198 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP62P37198 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP62P37198 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP62P37198 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP62P37198 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP62P37198 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP62P37198 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP62P37198 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP62P37198 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP62P37198 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP62P37198 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP62P37198 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP62P37198 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP62P37198 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP62P37198 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP62P37198 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP62P37198 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP62P37198 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP62P37198 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP62P37198 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP62P37198 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP62P37198 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP62P37198 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP62P37198 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP62P37198 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP62P37198 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP62P37198 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP62P37198 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP62P37198 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP62P37198 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP62P37198 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP62P37198 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP62P37198 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP62P37198 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP62P37198 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP62P37198 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP62P37198 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP62P37198 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP62P37198 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP62P37198 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP62P37198 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP62P37198 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP62P37198 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP62P37198 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP62P37198 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP62P37198 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP62P37198 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP62P37198 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP62P37198 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP62P37198 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP62P37198 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP62P37198 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP62P37198 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP62P37198 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP62P37198 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP62P37198 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP62P37198 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP62P37198 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP62P37198 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP62P37198 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP62P37198 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP62P37198 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP62P37198 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP62P37198 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP62P37198 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP62P37198 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP62P37198 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP62P37198 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP62P37198 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP62P37198 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP62P37198 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP62P37198 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP62P37198 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP62P37198 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP62P37198 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP62P37198 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP62P37198 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP62P37198 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP62P37198 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP62P37198 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP62P37198 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP62P37198 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP62P37198 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP62P37198 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP62P37198 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP62P37198 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP62P37198 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP62P37198 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP62P37198 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP62P37198 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP62P37198 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP62P37198 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP62P37198 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP62P37198 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP62P37198 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP62P37198 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP62P37198 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms