Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
DDIT3P35638 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms