Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms