Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms