Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPC1P35052 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPC1P35052 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPC1P35052 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPC1P35052 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPC1P35052 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPC1P35052 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPC1P35052 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPC1P35052 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPC1P35052 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPC1P35052 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPC1P35052 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GPC1P35052 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GPC1P35052 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPC1P35052 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPC1P35052 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPC1P35052 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPC1P35052 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPC1P35052 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPC1P35052 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPC1P35052 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPC1P35052 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPC1P35052 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPC1P35052 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GPC1P35052 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPC1P35052 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPC1P35052 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPC1P35052 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPC1P35052 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPC1P35052 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPC1P35052 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPC1P35052 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPC1P35052 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPC1P35052 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPC1P35052 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPC1P35052 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPC1P35052 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPC1P35052 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPC1P35052 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPC1P35052 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPC1P35052 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPC1P35052 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPC1P35052 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPC1P35052 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GPC1P35052 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPC1P35052 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPC1P35052 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPC1P35052 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPC1P35052 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPC1P35052 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPC1P35052 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPC1P35052 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPC1P35052 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPC1P35052 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPC1P35052 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPC1P35052 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPC1P35052 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPC1P35052 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GPC1P35052 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPC1P35052 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPC1P35052 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPC1P35052 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPC1P35052 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPC1P35052 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPC1P35052 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPC1P35052 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPC1P35052 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPC1P35052 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPC1P35052 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPC1P35052 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPC1P35052 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPC1P35052 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPC1P35052 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPC1P35052 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPC1P35052 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPC1P35052 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPC1P35052 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPC1P35052 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPC1P35052 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPC1P35052 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPC1P35052 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPC1P35052 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPC1P35052 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPC1P35052 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPC1P35052 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPC1P35052 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPC1P35052 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPC1P35052 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPC1P35052 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPC1P35052 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPC1P35052 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPC1P35052 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPC1P35052 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPC1P35052 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GPC1P35052 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPC1P35052 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPC1P35052 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPC1P35052 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GPC1P35052 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPC1P35052 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms