Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms