Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TM4SF1P30408 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TM4SF1P30408 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
TM4SF1P30408 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TM4SF1P30408 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TM4SF1P30408 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TM4SF1P30408 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TM4SF1P30408 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TM4SF1P30408 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TM4SF1P30408 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TM4SF1P30408 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TM4SF1P30408 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TM4SF1P30408 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TM4SF1P30408 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TM4SF1P30408 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TM4SF1P30408 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TM4SF1P30408 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TM4SF1P30408 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TM4SF1P30408 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TM4SF1P30408 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TM4SF1P30408 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TM4SF1P30408 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TM4SF1P30408 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TM4SF1P30408 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TM4SF1P30408 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TM4SF1P30408 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TM4SF1P30408 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TM4SF1P30408 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TM4SF1P30408 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TM4SF1P30408 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TM4SF1P30408 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TM4SF1P30408 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TM4SF1P30408 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TM4SF1P30408 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TM4SF1P30408 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms