Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GCAP28676 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GCAP28676 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GCAP28676 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GCAP28676 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GCAP28676 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GCAP28676 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GCAP28676 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GCAP28676 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GCAP28676 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GCAP28676 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GCAP28676 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GCAP28676 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GCAP28676 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GCAP28676 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GCAP28676 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GCAP28676 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GCAP28676 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GCAP28676 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GCAP28676 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GCAP28676 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GCAP28676 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GCAP28676 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GCAP28676 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GCAP28676 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GCAP28676 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCAP28676 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GCAP28676 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCAP28676 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCAP28676 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCAP28676 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCAP28676 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCAP28676 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCAP28676 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCAP28676 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCAP28676 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCAP28676 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCAP28676 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCAP28676 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCAP28676 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCAP28676 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GCAP28676 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCAP28676 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCAP28676 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCAP28676 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCAP28676 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCAP28676 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCAP28676 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCAP28676 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCAP28676 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCAP28676 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCAP28676 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCAP28676 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCAP28676 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCAP28676 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCAP28676 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCAP28676 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCAP28676 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GCAP28676 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCAP28676 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCAP28676 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCAP28676 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GCAP28676 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCAP28676 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GCAP28676 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GCAP28676 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GCAP28676 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCAP28676 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCAP28676 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCAP28676 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCAP28676 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCAP28676 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCAP28676 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCAP28676 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCAP28676 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCAP28676 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCAP28676 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCAP28676 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GCAP28676 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCAP28676 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCAP28676 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCAP28676 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCAP28676 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCAP28676 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCAP28676 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCAP28676 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCAP28676 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCAP28676 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCAP28676 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCAP28676 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCAP28676 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCAP28676 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCAP28676 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCAP28676 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCAP28676 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCAP28676 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCAP28676 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCAP28676 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCAP28676 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GCAP28676 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms