Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms